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本导图全面梳理了生物信息学数据库的基本概念、主要类型、应用领域以及发展趋势,旨在为大众提供一个清晰的知识框架,以便更好地理解和利用生物信息学数据库资源。
大纲
- 生物信息学数据库知识导图
- 一、生物信息学数据库概述
- 定义
- 利用计算机信息技术存储、分析、处理生物学数据的数据库
- 学科归属
- 生物学
- 定义
- 二、国际生物信息学数据库分类
- 1. 核酸序列数据库
- 主要数据库
- GenBank
- EMBL
- DDBJ
- 数据同步
- 每日交换数据
- 主要数据库
- 2. 蛋白质序列数据库
- 主要数据库
- PIR-PSD
- Swiss-Prot
- TrEMBL
- UniProt
- 功能特点
- 非冗余序列
- 详细注释
- 主要数据库
- 3. 蛋白质结构数据库
- 主要数据库
- Protein Data Bank (PDB)
- Molecular Modeling Database (MMDB)
- 数据来源
- X射线单晶衍射
- 核磁共振
- 冷冻电镜
- 主要数据库
- 4. 基因组数据库
- 主要数据库
- NCBI Genome Database
- EMBL-European Bioinformatics Institute
- 数据内容
- 基因组序列
- 图谱
- 染色体
- 装配
- 注释
- 主要数据库
- 1. 核酸序列数据库
- 三、生物信息学数据库的应用
- 基础分析
- 生物信息学分析基础
- 研究工具
- 生命科学研究工具
- 数据库增长
- 每年新增数据库数量
- 基础分析
- 四、生物信息学数据库的发展趋势
- 数据库数量
- 快速增长
- 应用领域
- 基因组学
- 蛋白质组学
- 系统生物学
- 数据库数量
- 一、生物信息学数据库概述
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